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S U P P O R T
 

Commercial Restriction Enzymes Sorted by the Type of DNA Ends Generated

Note

Single letter code:
R = G or A; 
Y = C or T; 
W = A or T; 
M = A or C; 
K = G or T; 
S = C or G;		 H = A, C or T;
V = A, C or G;
B = C, G or T;
D = A, G or T;
N = G, A, T or C.

Enzymes Generating 3'-protruding Ends

A,C    G,R,T

Recognition
sequence		 Enzyme 3'-protruding end (5'=>3')
1nt 2nt 3nt 4nt 9nt
ACGGA(11/9)^* TspGWI    NN      
ACGT^ TaiI        ACGT  
ACN^GT TaaI  N        
ACTGG(1/-1)^* BseNI    GN      
ACTGGG(5/4)^* BfiI  N        
ATGCA^T TspDTI        TGCA  
ATGCA^T Mph1103I        TGCA  
CACNNN^GTG AdeI      NNN    
^(0/2)CACTGC* BtsI    NN      
CAGNNN^CTG CaiI      NNN    
CASTG(2/-7)^ TspRI          NNCASTGNN
^(0/2)CATCC* BseGI    NN      
CATG^ Hin1II        CATG  
^(0/2)CATTGC* BseMI    NN      
^(-1/1)CCAGT* BseNI    NC      
CCANNNNN^NNNNTGG XcmI  N        
CCANNNNN^NTGG BstXI        NNNN  
CCANNNN^NTGG Van91I      NNN    
^(4/5)CCCAGT* BfiI  N        
CCGC^GG Cfr42I    GC      
CCNNNNN^NNGG BseLI      NNN    
CCTC(7/6)^* MnlI  N        
CCTGCA^GG SdaI        TGCA  
CGAT^CG PvuI    AT      
CGRY^CG Bsh1285I    RY      
CTCAG(10/8)^* BseMII   NN      
^(14/16)CTCCAG* GsuI    NN      
^(8/10)CTCCTC* BseRI    NN      
CTGAAG(16/14)^* Eco57I    NN      
CTGRAG(16/14)^* Eco57MI    NN      
^(8/10)CTGAG* BseMII    NN      
^(14/16)CTGCAC* BsgI    NN      
CTGCA^G PstI        TGCA  
CTGGAG(16/14)^*  GsuI    NN      
^(14/16)CTTCAG* Eco57I    NN      

 

 G, R, T

Recognition
sequence		 Enzyme 3'-protruding end (5'=>3')
1nt 2nt 3nt 4nt 9nt
GAAGA(8/7)^* MboII  N        
GAATGC(1/-1)^* Mva1269I   CN      
GACGT^C AatII        ACGT  
GACNNN^NNGTC Eam1105I  N        
GACNNNN^NNGTC AasI   NN      
GAGCT^C SacI        AGCT  
^(6/7)GAGG* MnlI  N        
GAGGAG(10/8)^* BseRI    NN      
GCAATG(2/0)^* BseMI    NN      
GCAGTG(2/0)^* BtsI    NN      
GCANNNN^NTGC BstAPI      NNN    
GCATG^C PaeI        CATG  
^(-1/1)GCATTC* Mva1269I    NG      
GCCNNNN^NGGC BglI      NNN    
GCGAT^CGC SgfI    AT      
GCNNNNN^NNGC HpyF10VI      NNN    
GDGCH^C SduI        DGCH  
^(5/6)GGATAC* BfuI  N        
GGATG(2/0)^* BseGI    NN      
GGCCGG^CC FseI        CCGG  
GGCCNNNN^NGGCC SfiI     NNN    
GGCGGA(11/9)^* EciI    NN      
GGGCC^C ApaI        GGCC  
GCSG^C TauI     CSG    
GGTAC^C KpnI        GTAC  
GGTGA(8/7)^* HphI  N        
GKGCM^C BseSI        KGCM  
GRGCY^C Eco24I        RGCY  
GTATCC(6/5)^* BfuI  N        
GTGCAG(16/14)^* BsgI    NN      
GWGCW^C Alw21I        WGCW  
RCATG^Y XceI        CATG  
TARCCA(11/9)^* TsoI   NN      
^(7/8)TCACC* HphI  N        
^(9/11)TCCGCC* EciI    NN      
^(9/11)TCCGT* TspGWI    NN      
^(7/8)TCTTC* MboII  N        
^(9/11)TGGYTA* TsoI   NN      
TTAAT^TAA PacI    AT      
^(9/11)TTCAT* TspDTI    NN      

  

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Updated liepos 16, 2007 09:14